心力衰竭数据挑战

美国心脏协会和黑人心脏病学家协会是促进健康公平和确保所有美国人有机会过上完整、健康生活的战略倡议的合作者。这些关联共同主办了一个数据挑战,以鼓励研究人员之间的交叉合作,以加深对围绕健康的社会和结构决定因素对心力衰竭的影响的理解。数据挑战特别侧重于测试心力衰竭与健康差距、健康的社会决定因素和健康的结构决定因素之间的关系。

  • 健康差距包括环境威胁、个人和行为因素、获得保健的机会不足、贫穷和教育不平等。
  • 健康的社会决定因素包括粮食供应、住房、经济和社会关系、教育和保健等资源。
  • 健康的结构性决定因素包括影响薪酬、工作条件、住房和教育的经济、治理和社会政策。

要求挑战参与者解决与心力衰竭和健康的社会/结构决定因素有关的有针对性的研究问题(下文)。鼓励团队利用遵循指导方针®(GWTG)-心力衰竭注册表数据以及通用数据和其他公开可用的数据集。所有数据必须去除标识。

每个挑战参与者将获得一次免费,精密医学平台工作空间进行所有的分析。为了安全性,必须使用工作区来输入和提交应用程序。所有工作空间均符合HIPPA和FedRAMP低认证。

挑战日期

开始日期:2021年3月16日
完2021年9月16日

研究问题

参赛者必须回答以下三个问题中的一个。如果参与者希望解决多个问题,则必须将每个问题作为单独的应用程序提交到单独的Precision Medicine Platform工作区中。

  1. 根据种族和民族,评估某些社会和/或结构健康决定因素对突发性心力衰竭风险的影响。
  2. 在HFrEF (EF< 40%)患者中,评估健康的某些社会和或结构决定因素对与入院相关的门诊护理的影响。
  3. 根据种族和民族,评估社会和/或健康结构决定因素对心力衰竭患者住院时间的影响。

奖项及评核

获奖者将于2021年10月获得三个奖项。大奖、二等奖或三等奖的获得者将被要求发表一份详细描述获奖方案的手稿,并将以标准提案为准评审过程

大奖:25000美元
第二名:10000美元
第三名:5000美元

评价

研究将由一个同行评审委员会进行评审,该委员会包括来自美国心脏协会和黑人心脏病学家协会的专家。审稿人将评估从分析中获得的新信息,以解决数据挑战问题的焦点。具体来说,委员会将评估:

  • 数据分析的结果或结果
  • 数据和数据分析(支持调查结果的方法)
  • 小说信息学会
  • 调查结果的总体影响和对问题重点的分析

如何参与

所有参与者都需要遵循以下步骤来接收工作区。每个团队将获得一个单独的共享工作区。

  1. 注册参与-在请求工作空间之前,每个团队成员都必须完成这个步骤。使用GWTG数据需要一份电子NDA-DUA表格。
  2. 创造精确医学平台帐户-挑战团队的每个成员都需要创建一个账号。已有帐户的参与者可以继续进行#3。
  3. 请求一个工作区-首席研究员应该请求工作空间。

注意:接收工作空间可能需要48小时。

资料

遵循指南-心衰数据

2017-2020年GWTG心衰数据将提供给参与者。这些数据最好用于解决问题2和3。

GWTG是美国心脏协会首屈一指的基于医院的质量改进计划,旨在缩小心血管疾病、中风和复苏方面的治疗差距。该计划为医疗保健提供者提供指导方针驱动的材料、信息和工具,以支持医院的质量改进工作。GWTG心力衰竭登记处收集患者水平数据元素以科学进步为基础的循证措施。鼓励参与者回顾质量的研究图书馆以确保他们的研究不会与现有的出版物重叠。在回顾收集的数据元素后,如果研究人员有关于他们的研究的可行性的其他问题,请联系qualityresearch@heart.org

附加数据

不允许使用GWTG数据链接或标记任何外部数据集。

鼓励参与者利用可获得的可泛化数据集,以及公开可用的纵向社区数据集(例如,Framingham心脏研究、动脉粥样硬化多种族研究、NHANES、CARDIA、西班牙裔/SOL、Jackson心脏研究、社区动脉粥样硬化风险研究)。

公开可用数据的访问和批准由申请人负责。有关联邦资助数据的有用链接,请访问BioLINCCdbGAP

提交申请

提交需求

精准医疗平台提供了一个易于使用的、基于网络的用户界面,允许参与者访问一个安全的、基于云的环境。它包含各种标准软件和包,如Python和r。平台工作空间利用Jupyter笔记本和RStudio允许用户创建记录和显示结果的笔记本。

每位参与者必须从其在Precision Medicine Platform中的个人工作区提交一份Jupyter笔记本,该笔记本提供以下内容:

  • 相应申请人和团队成员的全称
  • 机构(如适用)
  • 申请人的电子邮件地址
  • 申请人的电话号码
  • 一份250字的研究结果及应用说明
  • 用于建立、测试和验证模型的数据分析和数据集的描述
  • 图表(如适用)
  • 总结

提交结果/笔记本

一旦分析完成,笔记本准备提交,根据上面概述的标准,遵循以下步骤提交笔记本进行审查。所有提交必须在2021年9月16日下午5点前完成。CT。

  1. 提交的笔记本必须是HTML格式的。在木星,遵循以下步骤:
    1. 在文件菜单中,选择下载> HTML (.html).HTML文件将下载到一个临时下载文件夹
    2. 单击将HTML文件重新上载到工作区上传JupyterLab中的图标或单击上传按钮。
  2. 在工作区中,将笔记本保存在/mnt/workspace/My_notebes目录中,这将使笔记本与工作区门户
  3. 工作空间门户页面将列出该笔记本。在笔记本的右边,点击带箭头的方框。
  4. 共享笔记本创建了一个静态链接,将被心力衰竭数据挑战同行评审团队使用。
    注意:同行评议小组只能看到本子上的信息。因此,在分享之前,你必须包含所有必要的内容。如果您在共享之后做了更改,您将不得不重新共享。
  5. 精确医学工作区将在数据挑战的最后一天下午5点关闭。数据将根据我们的标准安全策略保存一段时间。工作区将保留给付费客户。